Ora eu tive um problema parecido, mas as contas eram ambas jogadas na Xbox...
Grosso modo a minha filha começou a jogar usando a minha conta (email) na Xbox Series X e foi progredindo até que um dia lá fiz uma conta para ela na Epic julgo eu, e como seria de esperar nessa conta não tinha nada.
Sei que na altura contactei o suporte la do Fortnite (ou Epic, já nem sei bem) e com algum trabalho conseguiram migrar o progresso existente na minha conta para a conta dela ou algo do género. Já não tenho em memória o que aconteceu, mas sei que foi possível resolver a coisa, mas que deu algum trabalho deu.
Por isso entra em contacto com eles e explica o que pretendes e talvez te consigam ajudar / resolver a situação tal como foi com a minha.